Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC9

SMARCAL1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAL1Q9NZC9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCAL1Q9NZC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms