Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PODXL2Q9NZ53 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PODXL2Q9NZ53 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PODXL2Q9NZ53 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms