Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCM9Q9NXL9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms