Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TOR4AQ9NXH8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TOR4AQ9NXH8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms