Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OXSMQ9NWU1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.33■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OXSMQ9NWU1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms