Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP5S1Q9NUS5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP5S1Q9NUS5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms