Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GJB4Q9NTQ9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB4Q9NTQ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB4Q9NTQ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms