Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFRSF19Q9NS68 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TNFRSF19Q9NS68 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms