Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLE3Q9NRF9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLE3Q9NRF9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms