Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD3

EXOSC4, Exosome complex component RRP41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC4Q9NPD3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC4Q9NPD3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EXOSC4Q9NPD3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms