Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMURF1Q9HCE7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMURF1Q9HCE7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms