Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC28A3Q9HAS3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC28A3Q9HAS3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms