Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC46A2Q9BY10 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC46A2Q9BY10 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms