Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VN1R3Q9BXE9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VN1R3Q9BXE9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms