Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRDL1Q9BU40 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRDL1Q9BU40 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms