Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF354BQ96LW1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF354BQ96LW1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms