Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SENP8Q96LD8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP8Q96LD8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms