Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMX3Q96JJ7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms