Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BORCS6Q96GS4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BORCS6Q96GS4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BORCS6Q96GS4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms