Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALML4Q96GE6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALML4Q96GE6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALML4Q96GE6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALML4Q96GE6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALML4Q96GE6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms