Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL38Q96DV4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL38Q96DV4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL38Q96DV4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms