Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TIFAQ96CG3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIFAQ96CG3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms