Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMIGD2Q96BF3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.1 ms