Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASKIN2Q8WXE0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms