Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ANKRD42Q8N9B4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms