Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBR7Q8N806 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR7Q8N806 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms