Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC170Q8IYT3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC170Q8IYT3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms