Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNX29P2Q8IUI4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNX29P2Q8IUI4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms