Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SETXQ7Z333 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SETXQ7Z333 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms