Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
USP43Q70EL4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
USP43Q70EL4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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