Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BBS12Q6ZW61 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BBS12Q6ZW61 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms