Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYDE1Q6ZW31 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYDE1Q6ZW31 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms