Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV89

SH2D5, SH2 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D5Q6ZV89 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH2D5Q6ZV89 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH2D5Q6ZV89 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms