Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCD1Q6ZMY3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCD1Q6ZMY3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms