Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT80Q6KB66 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT80Q6KB66 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms