Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TYW3Q6IPR3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms