Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP135Q66GS9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP135Q66GS9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms