Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD13Q5VXD3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SAMD13Q5VXD3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms