Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACHD1Q5VU97 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACHD1Q5VU97 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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