Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC38Q5VT99 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC38Q5VT99 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms