Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RPRD2Q5VT52 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
RPRD2Q5VT52 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RPRD2Q5VT52 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms