Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BEND3Q5T5X7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BEND3Q5T5X7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms