Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIF1Q5T3J3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRIF1Q5T3J3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms