Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CELF3Q5SZQ8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF3Q5SZQ8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF3Q5SZQ8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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