Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NUP188Q5SRE5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NUP188Q5SRE5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms