Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9R7

PPP6R3, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6R3Q5H9R7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP6R3Q5H9R7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP6R3Q5H9R7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP6R3Q5H9R7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP6R3Q5H9R7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP6R3Q5H9R7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP6R3Q5H9R7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP6R3Q5H9R7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP6R3Q5H9R7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP6R3Q5H9R7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP6R3Q5H9R7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP6R3Q5H9R7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP6R3Q5H9R7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms