Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK2Q5EBM0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK2Q5EBM0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms