Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SVEP1Q4LDE5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SVEP1Q4LDE5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms