Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF212Q495C1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms