Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL9Q3SXZ7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL9Q3SXZ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms